故事承接第一部结尾，自从森林王子莫格利（海利·乔·奥斯蒙 Haley Joel Osment配音）我决定就在这里吸收这些火晶石的能量，等完全吸收了这些火晶石的元力，我才出去，你们如果在这里待腻了，可以先到外面去，无论是在近处找个酒店等我，还是回我在中央区的房子里等都行。总之，不吸收完这些火晶石的能量，我是不会出去的。认识了人类女孩珊迪（梅·惠特曼 Mae Whitman配音），便随她一同居住在人类村庄中。然而离开丛林生活的莫格利，却在新的环境里异常想念他的动物朋友们，尤其是待他非常好的黑熊巴洛（约翰·古德曼 John Goodman配音）。来自远方森林的召唤，让莫格利决定重新回到森林的怀抱中去。然而从前自由自在的森林生活，此刻却变得危机重重。老冤家老虎希瑞·坎（托尼·杰伊 Tony Jay配音）正在酝酿一场复仇计划。
