讲述日本海洋研究开发机构「JAMSTEC」的潜水调查船「深海6500」，天谷深雪（有村架纯）属於当中的调查队，她的父亲厚志是驾驶员也是在这一天晚上，卫柱国又收到另一条消息，原本他以为童星光死后，群龙无首的东方军区会四分五裂，却怎么也没有料到童星光的妹妹童月华在几个统兵大将的鼎力支持下，已经自封为东方军区的镇守将军。童星光绰号金将军，童月华就自取了一个银将军的称号。兼研究者，她小时候听到父亲有关深海的事後，决定以探索海洋为目标，在她的父亲病死後，深雪以驾驶员候补生身份每日工作着。某天她有机会乘上「深海6500」，而JAMSTEC也大力宣传首个日本女性驾驶员诞生，然而在潜航前深雪在父亲的储物柜发现一盒录影带，内有看到深海未知巨大生物的船员的恐怖影像，也有她父亲最後的身影，之後恐怖真的袭来，深雪能否从黑暗的深海安全回来？
